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科学技術計算分科会 2016年度会合 [開催済]
進展する計算科学と未来像

太陽には11年の磁場活動周期があり、それにともなう首尾一貫した法則がある。太陽の磁場は、その内部で乱流的なプラズマの熱対流運動によって作られていると考えられているが、カオス的な動きから首尾一貫した法則をどのように形成するかは大きな謎である。この謎に挑戦する最近のスーパーコンピュータを利用した理論研究について詳しく紹介する。

進行癌に対して示された抗PD-1抗体および抗PD-L1抗体の顕著な有効性は、発がんにおけるPD-1/PD-L1を介した免疫回避の重要性を強く支持している。今回我々は、PD-L1遺伝子の3'-UTRの破壊を伴う構造異常を介した、がんの免疫回避のユニークなメカニズムを見いだした。頻度の高いがん種にわたって広く認められるこれらの構造異常に伴って、正常な3'-UTRが失われる結果、安定化したPD-L1のトランスクリプトの過剰発現が誘導される。今回の知見は、3'-UTRを介したPD-L1遺伝子発現の新たなメカニズムの解明のみならず、抗PD-1/PD-L1抗体の有効性を予測する新たなパイオマーカーの開発に資すると考えられる。

ポストペタアプリ性能WGでは、会員が開発した各分野のアプリケーションプログラムを対象に、京、FX10、FX100上での性能分析・評価およびチューニングを実施することで、マルチコアからメニーコアクラスタマシンに向けた並列プログラミングモデルや高速化の検討およびノウハウの共有を行った。従来からの連続体系のアプリケーションに加えて、分子動力学、遺伝子解析など新しいアプリケーションの評価も行った。ここでは、本WG活動を通じて得られた実践的な成果について報告する。はたして、我々は溢れだしたコアを使いこなせているのであろうか？

富士通は、スーパーコンピュータ「京」で性能解析ツールの基盤を開発し、理化学研究所と議論しながらこれまで性能解析ツールのエンハンス続けてきた。現在は、基本プロファイラ、詳細プロファイラ、精密PAの三つのツールを体系化し、「京」やPRIMEHPCシリーズに提供している。本発表では、実際のアプリケーションの事例を交えながら性能分析の手順を示した上で、富士通の性能解析ツールの特徴を紹介する。