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アンケート結果

科学技術計算分科会 2014年度会合 [開催済]
次世代HPCを支える技術

藤澤らのJST CREST研究チームは、大規模なグラフの高速な探索処理を行うソフトウェアの開発を2011年から進めてきた。冗長なグラフ探索を削減するアルゴリズムの利用、高速なネットワークで接続された超並列計算機上での通信性能の最適化、マルチコアプロセッサ上でのメモリへのアクセス最適化などの先進的技術を高度に組み合わせることにより、大規模グラフ探索能力を計測するGraph500、及び省電力性を計測するGreen Graph500ベンチマークにおいて世界第1位(京コンピュータなど)の高成績を達成した。

我々は現在分子動力学計算専用計算機「MDGRAPE-4」の開発を進めている。MDGRAPE-4はタンパク質の分子シミュレーションの加速のため、特に強スケーリング性能の向上を目指している。そのため、これまでのGRAPEシリーズのように「汎用計算機の加速装置」と位置づけではなく、米国D.E.Shaw ResearchのANTONと同様に、汎用コア・専用パイプライン・メモリ・ネットワーク等を集積したシステムオンチップを開発し、その並列化による高性能の実現を図っている。講演では開発の現況を述べる。

広域かつ経過時間が長く、複雑形状を持つ地震災害問題のシミュレーションには高性能計算が不可欠となる。地震災害問題の中でも特に計算量が大きい地表面に近い柔らかい地盤の震動問題を正確に計算するため、非構造メッシュを使った非線形有限要素法による地盤振動シミュレーション手法を開発した。本報告では地盤震動シミュレーションの疎行列ソルバーで使われているアルゴリズムと、京コンピュータ上での性能を示し、東京を対象とした地盤震動シミュレーションの適用例を示す。

PRIMEHPC FX10後継機における性能、およびチューニングを紹介する。HPC_ACE2の開発により、アプリケーションの並列性は大きく向上している。各種アプリケーションカーネルの逐次性能データを参考に、アプリケーションの高速化に向けたチューニング手法を解説する。