| 目 次 |
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1. はじめに
1.1 背景と目的
1.2 WGメンバ
1.3 検討経緯 |
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2. 各プログラムの検討概要
2.1 並列行列積計算プログラム(概要)
2.2 三次元圧縮性流体解析プログラム:UPACS(概要)
2.3 燃焼を含む圧縮性流体プログラム(概要)
2.4 モチーフ検索プログラム(概要)
2.5 蛋白質配列設計プログラム:predseq(概要)
2.6 分子動力学プログラム:monte(概要)
2.7 PIC法によるプラズマ粒子計算プログラム(概要)
2.8 宇宙プラズマ電磁粒子ハイブリッドシミュレーションプログラム(概要) |
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| 3. SMP利用指針の検討 |
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| 4. チューニング・ツールの評価 |
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5. 各プログラムの検討詳細
5.1 並列行列積計算プログラム
5.2 三次元圧縮性流体解析プログラム:UPACS
5.3 燃焼を含む圧縮性流体プログラム
5.4 モチーフ検索プログラム
5.5 蛋白質配列設計プログラム:predseq
5.6 分子動力学プログラム:monte
5.7 PIC法によるプラズマ粒子計算プログラム
5.8 宇宙プラズマ電磁粒子ハイブリッドシミュレーションプログラム |
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| 6. 検討の中で出たコメント/提言と、その回答/対応 |
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| 7. おわりに |
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添付資料
・「3.SMP利用指針の検討」図1〜図25の数値データ
・「スカラ並列プログラミング チューンング・ガイド」公開URL |
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